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2023-01-29 01:38:30 • 公司新闻
重磅发布｜乐驰天下mNGS新冠病毒分型注释升级，，追踪最新变异！！！！
新冠病毒从2019年到现今，，，经过多次进化，，，，形成阿尔法、、、贝塔、、、德尔塔、、、、奥密克戎等变异毒株。。。不同亚型、、、、株系的传播能力和人体内的免疫逃逸能力有所差异，，，，因而对新冠病毒进行分型，，结合分析病毒变异情况，，精准把控疫情形势，，，调整防控策略，，，不断提高防控工作的科学性、、、、精准性、、、、有效性。。
近日，，乐驰天下宏基因组技术(mNGS)基于临床需求，，，，目前已对新冠病毒注释结果进行更新，，并提供目前绝大部分新冠病毒亚型的注释结果，，，为临床追踪病毒变异提供参考依据。。。。
检测升级内容
覆盖outbreak.info提供的新冠病毒主要变种/亚型：Alpha(9种变异株)、、、Beta(5种变异株)、、、、Gamma(17种变异株)、、、Lambda(2种变异株)、、、、Delta(79种变异株)、、、Omicron(≥749种变异株)等。。
分析方法：通过收录、、、、整理GISAID上新冠主要株系的高质量参考基因组序列，，，构建新冠谱系数据库，，，， 基于Pangolin(Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages，，以系统发育归类命名全球暴发分支)分型方法，，，对NGS测序数据中的病毒序列进行比对分析，，输出新冠的具体分型结果。。
（图片来源网络）
其他说明
(1) 适用范围：针对所有送检mNGS DNA+RNA双流程，，，，或RNA流程的样本；
(2) 适用样本类型：呼吸道样本(肺泡灌洗液、、、、痰液、、咽拭子)、、、血液、、、、脑脊液以及其他可能检出新型冠状病毒基因组的样本；
(3) mNGS RNA流程检出特异性reads数＞3000时，，分型结果较为准确；检出新冠病毒特异性reads数为1000~3000时，，，分型结果仅供参考。。。。
临床样本新冠检出情况
(图1 近期临床样本不同新冠亚型检出的占比)
(图2 新冠病毒在不同样本类型中检出的占比)
目前，，，乐驰天下精准医学中心已经形成了mNGS、、、、tNGS为核心的感染性疾病病原学分子检测的产品体系，，，本次mNGS升级将助力于新冠病毒感染的诊断、、病毒分型、、变异追踪以及疫情的精准防控。。。
乐驰天下mNGS检测在标准化检测流程的基础上，，通过临床样本的大数据统计，，，不断响应临床需求，，优化生信分析系统及临床解读，，提高检测的灵敏度和准确性。。。。
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乐驰天下
乐驰天下集团源于中山大学，，，，致力于医学健康服务业的发展，，，聚焦于客户的健康需求，，，提供有竞争力的解决方案与服务，，，为大众创造幸福生活。。。。
如欲了解更多信息，，，敬请联系邮箱pr@tant365.com。。。。
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